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喻树迅院士团队研究成果揭示陆地棉早熟遗传机制


【发布时间:2020-07-14 14:35:44  点击量:


近日,我校农业与食品科学学院喻树迅院士团队利用436份重测序基因组数据构建SNP变异图谱揭示陆地棉早熟遗传机制,研究成果以“Genomic analyses reveal the genetic basis of early maturity and identification of loci and candidate genes in upland cotton (Gossypium hirsutumL.)”为题在《Plant Biotechnology Journal》(影响因子为8.154)上发表。

该研究通过对包含136份早熟棉资源在内的356份陆地棉材料进行深度重测序,并结合公共数据库中的80份陆地棉材料共获得了10,118,884个高质量的SNPs。通过多年多环境对群体的7个早熟性相关性状环境的表型数据调查及研究,表明早熟性存在广泛的遗传变异。利用GWAS鉴定了控制陆地棉早熟性的307个显著遗传位点与重要调控基因。两个早熟遗传热点区域位于D03和A05染色体,共包括88.92%的关联位点。其中在D03号染色体发现与标记rsD03_39122594紧密连锁的棉花早熟候选基因Ghir_D03G011310,并发现其在短季棉育种历程中受到了强烈的人工选择。在A05号染色体发现Ghir_A05G017390和其在Dt亚基因组中的同源基因与果枝始节位高度和株高显著关联。通过VIGS技术发现抑制Ghir_A05G017390在“中50”中的表达可以影响植株高度。综上所述,该研究结果对棉花早熟性状遗传解析及品种遗传改良具有重要意义。

该研究得到了国家重点研发计划、国家棉花产业技术体系、国家自然科学基金和9499www威尼斯院士团队科研启动费等经费的资助。9499www威尼斯为第一单位,农学院李黎贝博士为该论文第一作者。

(农学院)




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